Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF7Q6Q0C0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms