Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBA3EQ6PEY2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3EQ6PEY2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3EQ6PEY2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3EQ6PEY2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3EQ6PEY2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3EQ6PEY2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3EQ6PEY2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3EQ6PEY2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3EQ6PEY2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3EQ6PEY2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3EQ6PEY2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms