Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6P435 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6P435 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6P435 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6P435 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6P435 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6P435 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6P435 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6P435 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6P435 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6P435 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6P435 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6P435 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6P435 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6P435 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6P435 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6P435 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6P435 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q6P435 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q6P435 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q6P435 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q6P435 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q6P435 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q6P435 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms