Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms