Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4Q6IC98 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms