Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
INTS3Q68E01 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
INTS3Q68E01 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms