Protein–RNA interactions for Protein: Q685J3

MUC17, Mucin-17, humanhuman

Predictions only

Length 4,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC17Q685J3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MUC17Q685J3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms