Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH8Q5T0T0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms