Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMPD3Q5JV73 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD3Q5JV73 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms