Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms