Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF212Q495C1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms