Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF1Q3BBV0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms