Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL24A1Q17RW2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COL24A1Q17RW2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
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