Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms