Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPROQ16827 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
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