Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC37Q16543 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC37Q16543 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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