Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TAF1AQ15573 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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