Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRKQ15262 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
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