Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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