Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PDCD1Q15116 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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