Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms