Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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