Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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SPIDRQ14159 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIDRQ14159 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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