Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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