Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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