Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRQ13535 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRQ13535 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRQ13535 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRQ13535 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRQ13535 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRQ13535 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRQ13535 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRQ13535 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRQ13535 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRQ13535 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRQ13535 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRQ13535 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRQ13535 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRQ13535 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRQ13535 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRQ13535 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRQ13535 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRQ13535 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRQ13535 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRQ13535 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRQ13535 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRQ13535 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRQ13535 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRQ13535 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRQ13535 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRQ13535 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRQ13535 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRQ13535 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRQ13535 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRQ13535 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRQ13535 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRQ13535 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRQ13535 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRQ13535 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRQ13535 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRQ13535 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRQ13535 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRQ13535 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRQ13535 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRQ13535 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRQ13535 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRQ13535 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRQ13535 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRQ13535 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRQ13535 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRQ13535 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRQ13535 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRQ13535 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRQ13535 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRQ13535 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRQ13535 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRQ13535 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRQ13535 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRQ13535 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRQ13535 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRQ13535 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRQ13535 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRQ13535 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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