Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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