Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
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