Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FOXF2Q12947 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
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