Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TROQ12816 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TROQ12816 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TROQ12816 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TROQ12816 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TROQ12816 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TROQ12816 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TROQ12816 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TROQ12816 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TROQ12816 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TROQ12816 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TROQ12816 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TROQ12816 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TROQ12816 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TROQ12816 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TROQ12816 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TROQ12816 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TROQ12816 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TROQ12816 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TROQ12816 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TROQ12816 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TROQ12816 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TROQ12816 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TROQ12816 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TROQ12816 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TROQ12816 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TROQ12816 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TROQ12816 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TROQ12816 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TROQ12816 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TROQ12816 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TROQ12816 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TROQ12816 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TROQ12816 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TROQ12816 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TROQ12816 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TROQ12816 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TROQ12816 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TROQ12816 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TROQ12816 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TROQ12816 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TROQ12816 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TROQ12816 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TROQ12816 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TROQ12816 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TROQ12816 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TROQ12816 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TROQ12816 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TROQ12816 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TROQ12816 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TROQ12816 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TROQ12816 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TROQ12816 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TROQ12816 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TROQ12816 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TROQ12816 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TROQ12816 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TROQ12816 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TROQ12816 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TROQ12816 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TROQ12816 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TROQ12816 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TROQ12816 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TROQ12816 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TROQ12816 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TROQ12816 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TROQ12816 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TROQ12816 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TROQ12816 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TROQ12816 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TROQ12816 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TROQ12816 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TROQ12816 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TROQ12816 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TROQ12816 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TROQ12816 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TROQ12816 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TROQ12816 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TROQ12816 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TROQ12816 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TROQ12816 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TROQ12816 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TROQ12816 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TROQ12816 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TROQ12816 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TROQ12816 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TROQ12816 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TROQ12816 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TROQ12816 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TROQ12816 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TROQ12816 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TROQ12816 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TROQ12816 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TROQ12816 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TROQ12816 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TROQ12816 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TROQ12816 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TROQ12816 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TROQ12816 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TROQ12816 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
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