Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCK1Q08629 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms