Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms