Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms