Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms