Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC31.57■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms