Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms