Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1BQ00975 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms