Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms