Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms