Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PIP4K2BP78356 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2BP78356 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2BP78356 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2BP78356 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2BP78356 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2BP78356 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2BP78356 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2BP78356 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2BP78356 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2BP78356 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2BP78356 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms