Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms