Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTA2P62736 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTA2P62736 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms