Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms