Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARF3P61204 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARF3P61204 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARF3P61204 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARF3P61204 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARF3P61204 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARF3P61204 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARF3P61204 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARF3P61204 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARF3P61204 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARF3P61204 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARF3P61204 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ARF3P61204 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARF3P61204 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ARF3P61204 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARF3P61204 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARF3P61204 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARF3P61204 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARF3P61204 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARF3P61204 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARF3P61204 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARF3P61204 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARF3P61204 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARF3P61204 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARF3P61204 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARF3P61204 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARF3P61204 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARF3P61204 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARF3P61204 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARF3P61204 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARF3P61204 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARF3P61204 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARF3P61204 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARF3P61204 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARF3P61204 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARF3P61204 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARF3P61204 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARF3P61204 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARF3P61204 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARF3P61204 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARF3P61204 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARF3P61204 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARF3P61204 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARF3P61204 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARF3P61204 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARF3P61204 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARF3P61204 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARF3P61204 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARF3P61204 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARF3P61204 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARF3P61204 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARF3P61204 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARF3P61204 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARF3P61204 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARF3P61204 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARF3P61204 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARF3P61204 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARF3P61204 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARF3P61204 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARF3P61204 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms