Protein–RNA interactions for Protein: P51858

HDGF, Hepatoma-derived growth factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFP51858 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HDGFP51858 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDGFP51858 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDGFP51858 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDGFP51858 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDGFP51858 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDGFP51858 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDGFP51858 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDGFP51858 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDGFP51858 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDGFP51858 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDGFP51858 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDGFP51858 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDGFP51858 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDGFP51858 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDGFP51858 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDGFP51858 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDGFP51858 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDGFP51858 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDGFP51858 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDGFP51858 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDGFP51858 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDGFP51858 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HDGFP51858 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDGFP51858 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDGFP51858 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDGFP51858 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HDGFP51858 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDGFP51858 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HDGFP51858 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDGFP51858 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDGFP51858 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDGFP51858 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDGFP51858 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDGFP51858 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDGFP51858 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDGFP51858 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDGFP51858 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDGFP51858 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDGFP51858 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDGFP51858 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDGFP51858 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDGFP51858 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDGFP51858 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDGFP51858 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDGFP51858 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDGFP51858 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDGFP51858 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDGFP51858 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDGFP51858 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDGFP51858 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDGFP51858 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDGFP51858 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDGFP51858 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDGFP51858 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDGFP51858 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDGFP51858 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDGFP51858 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDGFP51858 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDGFP51858 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDGFP51858 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDGFP51858 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDGFP51858 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDGFP51858 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDGFP51858 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDGFP51858 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDGFP51858 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDGFP51858 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDGFP51858 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HDGFP51858 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDGFP51858 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDGFP51858 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDGFP51858 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDGFP51858 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDGFP51858 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDGFP51858 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDGFP51858 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDGFP51858 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDGFP51858 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDGFP51858 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDGFP51858 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HDGFP51858 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HDGFP51858 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDGFP51858 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDGFP51858 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDGFP51858 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDGFP51858 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDGFP51858 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDGFP51858 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDGFP51858 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDGFP51858 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDGFP51858 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDGFP51858 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDGFP51858 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDGFP51858 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDGFP51858 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDGFP51858 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDGFP51858 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDGFP51858 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDGFP51858 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms