Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP11P51784 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP11P51784 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP11P51784 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP11P51784 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP11P51784 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP11P51784 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP11P51784 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP11P51784 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP11P51784 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP11P51784 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP11P51784 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP11P51784 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP11P51784 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP11P51784 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP11P51784 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP11P51784 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP11P51784 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP11P51784 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP11P51784 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP11P51784 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP11P51784 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP11P51784 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP11P51784 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP11P51784 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP11P51784 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP11P51784 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP11P51784 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP11P51784 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP11P51784 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP11P51784 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP11P51784 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP11P51784 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP11P51784 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP11P51784 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP11P51784 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP11P51784 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP11P51784 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP11P51784 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP11P51784 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP11P51784 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP11P51784 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP11P51784 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP11P51784 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP11P51784 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP11P51784 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms