Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms