Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPFP49454 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPFP49454 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPFP49454 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPFP49454 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPFP49454 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPFP49454 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPFP49454 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPFP49454 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPFP49454 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPFP49454 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPFP49454 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPFP49454 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPFP49454 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPFP49454 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPFP49454 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPFP49454 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPFP49454 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPFP49454 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPFP49454 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPFP49454 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPFP49454 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPFP49454 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPFP49454 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPFP49454 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPFP49454 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPFP49454 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CENPFP49454 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPFP49454 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPFP49454 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPFP49454 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPFP49454 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CENPFP49454 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPFP49454 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPFP49454 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPFP49454 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPFP49454 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPFP49454 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPFP49454 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPFP49454 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPFP49454 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPFP49454 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPFP49454 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPFP49454 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPFP49454 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPFP49454 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPFP49454 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPFP49454 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPFP49454 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPFP49454 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPFP49454 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPFP49454 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPFP49454 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPFP49454 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPFP49454 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPFP49454 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPFP49454 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms