Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTAP49354 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTAP49354 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTAP49354 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms