Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCLMP48507 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCLMP48507 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCLMP48507 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCLMP48507 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCLMP48507 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCLMP48507 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCLMP48507 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCLMP48507 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCLMP48507 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCLMP48507 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCLMP48507 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GCLMP48507 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCLMP48507 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GCLMP48507 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GCLMP48507 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GCLMP48507 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GCLMP48507 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCLMP48507 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms